Se você não insistir em usar o gnome-keyring, será fácil. ssh-agent é a ferramenta que você deseja. Você pode adicionar chaves ao agente em execução com ssh-add path/to/keyfile e listar as chaves ativas com ssh-add -l .
Depois de adicionar uma chave ao agente, você pode usar ssh como está agora, mas as chaves são fornecidas por ssh-agent .