A menos que exista um sistema cliente-servidor extra, eu leio a sua pergunta a seguir.
Você tem uma rede com vários computadores, usados como clientes Windows, e um computador usado como servidor Ubuntu. Esses computadores não têm um relacionamento especial, apenas "estão" na rede. Agora você deseja desativar o recurso "usar dispositivos de armazenamento USB" nos computadores com Windows
Então não: seu computador ubuntu 'aleatório' (que atualmente é designado como 'servidor') não pode forçar outro computador a restringir o acesso USB. Isso é tudo local. O próprio computador deve fazer isso.
Agora as soluções podem ser as permissões de configuração do sistema operacional Windows. Deve ser do lado do windows. O que você pode fazer é fazer com que seus computadores Windows 'procurem' por um mestre (servidor de domínio, por exemplo) e esse servidor define as políticas. Mas o que você ainda precisa mudar as máquinas do Windows, e eu não sei de nenhum método para definir as políticas do Windows do Ubuntu ...