Se o Thunderbird puder pesquisar por e-mails relacionados ao trabalho, por exemplo, porque você os identificou como "trabalho" ou forem enviados de algum endereço @ sua-empresa.com, você poderá salvar essa pesquisa como uma pasta virtual. Essa pasta virtual será atribuída a uma das suas contas de e-mail e exibida em sua lista de pastas, mas você poderá configurá-la para pesquisar em qualquer pasta de qualquer conta.
Faça uma busca por seus e-mails relacionados ao trabalho, por exemplo, "Tags include 'work'" ou "From includes 'my-company.com'". Na parte inferior dessa caixa de diálogo, deve haver um botão para armazenar essa pesquisa como uma pasta virtual.
Pressionar esse botão deve fornecer outro diálogo. Lá você pode definir o nome das pastas virtuais, em que conta ele deve ser exibido, em quais pastas ele deve pesquisar e os critérios de pesquisa.
Com isso, você pode, por exemplo, criar uma pasta virtual chamada "work for my-company.com" na sua conta do Gmail, que pesquisa no Gmail / Work, Yahoo / Work e Yahoo / Other-stuff para emails que foram enviados de um endereço @ minhacompanhia.com ou marcados como "trabalho".