Já faz algum tempo que tive problemas com o eclipse dando 100% de cpu ao inicializar. Depois de criar um novo espaço de trabalho e mudar para ele, percebi que as ferramentas de desenvolvimento do Android não são mais exibidas em lugar algum. Na verdade, File-New-project mostra apenas projetos "Geral" e "CVS". Eu tenho ia32 libs, eclipse-jdt, mas nada aparece, exceto no novo software Help-install, que diz que está instalado.
Eu executei o Eclipse com o sudo, atualizei e instalei tudo o que precisava, depois executei sudo chown -R username:username ./workspacedirectory . (Mesmo com um diretório .metadata, quando tive problemas mais tarde). Esta parece ser a solução! Estranho, já que algum tempo antes das atualizações de 13.04 eu tenho certeza que eu tentei algo assim.
Eu tive muitos problemas com o Eclipse que está nos repositórios do Ubuntu. Eu achei que é muito melhor apenas fazer o dowload e executá-lo diretamente. Se você usa o Android, recomendo o pacote do Android SDK / ADT . Não fica muito mais fácil do que isso. Se você precisar do Eclipse para outros projetos, poderá obtê-lo em em seu site .