Dê uma olhada no link . Às vezes, o instalador não pode posicionar corretamente o GRUB (menu de inicialização de primeiro nível) no disco rígido. Reparar é geralmente tão simples quanto executar a ferramenta Boot-Repair.
Acabei de instalar o Ubuntu 12.10. Quando solicitado a remover o dvd para reiniciar, não havia menu de opções de inicialização e o PC começou a carregar as janelas.
Checkdisk executou e exibiu várias mensagens, por exemplo. Deleting orphan file record segment 123416
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No Windows XP, meu C: \ foi reduzido pela quantidade de espaço alocado para as partições do Ubuntu.
Eu acessei o menu de inicialização e havia apenas a opção de inicialização normal do Windows e inicialização do Windows.