O Windows não funciona bem com outros sistemas operacionais. Quando você executou esse reparo, ele teria sobrescrito qualquer bootloader que você tivesse lá, tentado substituí-lo pelo MBR e com ele como o único SO. Ele também teria excluído qualquer particionamento e formatado seu HDD com NTFS.
Provavelmente é tarde demais para voltar. Os discos do Windows excluem tudo em um ponto em que você precisará de um software de recuperação de dados para recuperar o drive como estava.
O que funcionou para mim com o Win7 e a inicialização dupla é instalar o Windows primeiro. Isso ajudará com determinado hardware, como algumas placas sem fio também. Em seguida, você pode reduzir as partições NTFS em Gerenciamento do Computador > Gerenciamento de Disco para liberar espaço para o Linux. Se você instalar o Ubuntu em segundo lugar, ele deverá instalar o GRUB, que poderá então inicializá-lo diretamente ou passar para o carregador do Windows 7. Se a instalação do Windows quebrar por qualquer motivo, faça um backup antes de usar um disco de instalação.