Isso pode ser feito com o FFmpeg , embora não seja tão simples quanto usar o FMLE no Windows.
A resposta curta é que você usa um comando como
ffmpeg <commands to read the input>
-vcodec libx264 -vpre baseline \
-acodec libmp3lame -ab 32k \
-threads 0 \
-f flv "$STREAM_URL"
em que $STREAM_URL é o URL RTMP do Ustream, que incluirá seu ID do canal e sua chave de usuário.
Detalhes completos estão escritos nesta postagem do blog: link
Veja também esta pergunta: Como eu faço stream para o Twitch.tv?