Provavelmente é o bootloader do windows instalado, você tem que substituir aquele com o grub, você pode fazer isso com Resc-A-Tux
Este é um live cd com o objetivo principal: Restaurar o grub / instalar o grub. É um bom programa que eu usei depois que o windows acabou de remover meu grub sem perguntar, e funcionou como um encanto.
Quando você inicializa, um pop-up aparece. Neste pop-up você pode selecionar o grub de instalação / reparo. Selecione isto, ele irá pedir algumas coisas, mas se você clicar ok, ele irá instalar o grub já que ele é sempre instalado como padrão.
Uma pequena dica: sempre instale o Windows primeiro, pois o Windows apenas joga fora o grub sem perguntar.
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