Em primeiro lugar, vamos começar abordando a razão original pela qual isso aconteceu.
Wubi é muitas vezes visto erroneamente como instalar uma partição Linux. Na verdade, um arquivo é criado dentro do Windows (e dentro da partição do Windows), que age como uma partição do Ubuntu. Você pode visualizá-lo como se fosse uma partição virtual como no VirtualBox, por exemplo. A razão pela qual eu lhe digo é que, se esse arquivo tiver sido danificado no ambiente do Windows, ele causará problemas no Ubuntu.
No entanto, se isso foi completamente intocado e é puramente gráfico, então há uma chance de que o Xorg (gráficos no Linux) tenha que ser reconfigurado.
Geralmente isso é feito pressionando Ctrl + Alt + F2 e digitando 'sudo dpkg-reconfigure xserver-org' no prompt. Embora eu tenha a sensação de que isso pode não funcionar com o erro aparecendo.
Apenas por curiosidade, você consegue se lembrar exatamente do que fez ou estava tentando fazer dentro do Windows pouco antes de o problema ocorrer?