Eu recomendaria a instalação do eclipse no eclipse.org. Acesse o link e faça o download do pacote eclipse de sua preferência. Em seguida, acesse o link e faça o download da versão java apropriada para o seu sistema operacional ("Linux" para i386 "Linux x64 "para amd64). Extraia ambos os arquivos para uma pasta (eu geralmente crio ~ / bin). Você deve pegar duas pastas: eclipse e jre1.7.0_09.
Em seguida, edite o arquivo eclipse / eclipse.ini, adicione:
-vm
../jre1.7.0_09/bin/java
abaixo
-startup
plugins/org.eclipse.equinox.launcher_1.3.0.v20120522-1813.jar
Isso fará o eclipse sempre usar o java do Oracles. O Eclipse só é testado para ser executado no java do oracle.
Usando este método você pode fazer muitas instalações de eclipse com apenas ferramentas necessárias em cada uma delas.