Sugiro criar um liveusb / livecd para particionar seu disco rígido. Acer recentemente enviou o computador da minha irmã com uma partição de 70 gig para seus arquivos pessoais para entrar em ??? Tivemos que inicializar no Ubuntu para adicioná-lo à sua partição do Windows, pois só tínhamos 2 megas livres. Eu não acho que seria muito seguro particionar a unidade enquanto você a está usando e certifique-se de fazer backup de todos os seus dados pessoais usando o Ubuntu e as nuvens de dados da Microsoft (ou outro disco rígido), pois há sempre essa chance.
Além disso, você o instalou usando o Wubi?