Primeiro eu vou tentar responder a sua pergunta, então eu vou explicar porque você provavelmente não deveria fazer isso:)
Eu não vi ou ouvi falar de nenhum script de shell que faria isso, mas será relativamente fácil escrever um. Basta escrever um shell scripts e, a partir daí, pkill -os processos que você não precisaria devem fazer o truque, por exemplo.
#!/bin/bash
pkill zeitgeist-fts
pkill dropbox
Se você fizer um segundo script para executar os processos, por exemplo,
#!/bin/bash
zeitgeist-fts &
dropbox &
... você deve ser capaz de reiniciar esses processos (e para as pessoas mais experientes no site: por favor, edite se existe uma maneira melhor de encerrar / reiniciar esses processos). Pode ser melhor reiniciar a sessão, por exemplo saia ou mate o servidor X, e isso levará apenas alguns segundos.
Agora, eis o motivo pelo qual acredito que você ficará melhor com uma solução alternativa.
Matar muitos desses processos deixará você com um sistema instável, inseguro e provavelmente inutilizável. Se você pkill Dropbox estiver bem, mas pkill Zeitgeist e seu processo Unity não funcionarão como deveria. Tenha muito cuidado com os processos que você finaliza. Além disso, alguns processos não poderão terminar e simplesmente reiniciarão. Eu acho que é melhor deixá-los serem reiniciados. Se você bloquear o Compiz, por exemplo, pode ser muito chato reiniciá-lo manualmente quando precisar.
Parece que você precisa de todos os recursos do seu computador para executar o Minecraft. Para resumir, pode ser uma má idéia simplesmente despir o Ubuntu para liberar alguns recursos. Em vez disso, será melhor usar uma distribuição mais leve, como Lubuntu ou Xubuntu.