Eu recomendaria a instalação de uma cópia do USB ao vivo com o modo de persistência, já que ele é especificamente projetado para a execução de um dispositivo USB. Obviamente, não sabendo detalhes sobre o problema eu não poderia apontar para uma correção, mas eu uso USB e persistência muito para consertar máquinas windows mortos e parece funcionar bem:)
Para detalhes sobre como configurá-lo, veja aqui