Eu suponho que há um widget de emulador de terminal no seu geany (que é sugerido pelo pacote geany). Clique nele (no canto inferior esquerdo) e primeiro navegue até a pasta em que está seu arquivo de origem:
cd Path/To/Source
Para compilar o arquivo YourSourceFile.c , digite:
gcc YourSourceFile.c -o ProgramName
Para executar o tipo de programa:
./ProgramName