No Ubuntu Software Center, acesse o menu Edit e clique em Software Sources . Em seguida, vá para a guia "Outro Software" e remova os ppa que não estão conseguindo baixar.
Se você quiser adicionar qualquer um dos ppa novamente, a melhor maneira é executar sudo apt-add-repository ppa:someppa/ppa no terminal. Geralmente, você pode encontrar exatamente a string ppa:someppa/ppa na página do launchpad do PPA. Isso garantirá que o PPA seja adicionado com as chaves de assinatura corretas, portanto, ele deve parar de fornecer a você tantos avisos.