Graças a algumas super investigações de alguns amigos no trabalho, eu finalmente percebi isso. O problema é que eu tinha dois discos formatados em mdadm no computador, mas não o suficiente para iniciar o volume corretamente. A solução foi inicializar sem as unidades conectadas, apt-get remover o mdadm e, em seguida, reinicializar com as unidades conectadas novamente.
Então, eu pude reinstalar o mdadm e executar as etapas descritas aqui para finalmente ter o original inicializado sistema e meus dados intactos.