Após algumas pesquisas, eu achou que a parte" errors on disk "significava que o fsck era executado e o fato de que ele consertava" alguma coisa "significava que alguns dados no disco eram corrompidos.
Eu verifiquei a pasta perdida + encontrada e, de fato, ela continha alguns dos dados que eu estava perdendo. A maior parte, no entanto, se foi para sempre.