O problema que não permitia que a tecla "ENTER" abrisse a aplicação foi causado por alguns plugins do Gnome3 que eu tinha instalado. Usando o aplicativo de configurações avançadas do Gnome3, eu desliguei o "Advanced Search Extension" e o "Journal Extension", que resolveu o problema.
Você pode baixar o aplicativo Gnome 3 Advanced Settings (também conhecido como Gnome Tweak Tool) aqui: link