Você não pode usar o gparted para alterar uma partição que está montada. Você diz que não pode ver sua segunda partição, mas se ela estiver montada em / home, tudo nesta pasta estará na sua segunda partição.
Se você abrir o 'System Monitor' e clicar na aba 'File Systems', você poderá ver cada partição e onde ela está montada.
Se você gostaria de alterar uma partição, então você terá que fazê-lo a partir de um USB ou CD ao vivo, pois isso é a única maneira que você será capaz de mudar o HD sem montá-lo primeiro.