Tente os seguintes comandos em um terminal
amixer -c 0 set Master playback 0% mute
amixer -c 0 set Master playback 100% unmute
Isso deve garantir que todas as saídas sejam controladas. É provável que com seus comandos publicados a razão pela qual o volume não é 100% é que o amixer não libera todas as saídas, por exemplo, fones de ouvido ou qualquer outra saída de som ao mesmo tempo.