hmmm .... burg ou grub2? Se você usar o burg, substitua o update-grub pelo update-burg.
mantenha o seu fedora 15 usb flash plugado e montado quando você faz um sudo update-grub do seu hd ubuntu. então não atualize o grub quando o seu pen drive não estiver conectado.
outra maneira é apenas inicializar a partir do seu flash USB usando suas opções de bios. alguns bios usam o F8 para escolher de qual dispositivo inicializar. Diferentes bios usam chaves diferentes, mas uma vez que você aprende qual tecla pressionar, você pode inicializar rapidamente em sua unidade flash USB quando você quiser inicializar a partir dela.