Não há necessidade de um disco ao vivo. Você pode digitar gksu nautilus
em uma janela de terminal. O Nautilus abrirá dando-lhe privilégios de super-usuário, e você poderá mover o que quiser onde quiser.
Pode haver arquivos abertos que causam problemas, dependendo do que você deseja mover, mas você não deve movê-los de qualquer maneira.