Seria mais fácil se você pudesse lembrar o comando exato com o qual instalou os repositórios inválidos. Caso contrário, basta executar isso para descobrir em qual arquivo as linhas estão:
grep -r --include '*.list' 'deb.nodesource.com' /etc/apt
Se forem as únicas linhas no arquivo que não iniciam com # , você poderá excluir o arquivo inteiro. Senão, apenas remova essas linhas específicas. Você também pode simplesmente desativar as linhas comentando-as. Para fazer isso, basta escrever um # no início de cada linha.