Acho que você está confundindo o sistema operacional com uma máquina virtual. Você pode executar um script de inicialização fazendo com que o VDI seja carregado, mas o Ubuntu precisa estar em execução antes de iniciar os processos da VM.
A forma do comando seria vboxmanage startvm <vm/name/here> - você pode ler os arquivos de ajuda do VirtualBox para saber mais.