Você pode fazer isso com o grep.
Aqui está um exemplo:
$ echo localhost > local_hosts
$ grep -v -f local_hosts /etc/hosts
127.0.1.1 ubuntu
# The following lines are desirable for IPv6 capable hosts
fe00::0 ip6-localnet
ff00::0 ip6-mcastprefix
ff02::1 ip6-allnodes
ff02::2 ip6-allrouters