Não há nada que você precise fazer. A rota 169.254.0.0 normalmente está presente para todos com conectividade à Internet. Aqui está a informação da rota da minha máquina:
chili@T440p:~$ route -n
Kernel IP routing table
Destination Gateway Genmask Flags Metric Ref Use Iface
0.0.0.0 192.168.0.1 0.0.0.0 UG 600 0 0 wlp3s0
169.254.0.0 0.0.0.0 255.255.0.0 U 1000 0 0 wlp3s0
192.168.0.0 0.0.0.0 255.255.255.0 U 600 0 0 wlp3s0
Consulte: link
Veja especialmente:
A rede 169.254.0.0/16 é usada para o IP privado automático Endereçamento, ou APIPA. Se um cliente DHCP tentar obter um endereço, mas não consegue encontrar um servidor DHCP após o tempo limite e tentativas de novo irá assumir aleatoriamente um endereço desta rede. Isso permite comunicação com hosts que não conseguiram obter um endereço DHCP.
Em suma, a entrada é totalmente normal.