A empatia não tem esse cenário.
Mas você pode configurar a área de notificação do xfce para ocultar ícones específicos:
Basta clicar com o botão direito em um espaço vazio do painel, clicar no painel e na caixa de diálogo a seguir, localize a 'área de notificação' na guia 'objetos' e marque a caixa de seleção na coluna 'oculta'.