Você pode verificar este link útil para saber mais sobre as diferenças entre 32bit, 32bit pae e 64bit: Como decidir se você deve usar 32bit ou 64bit .
De qualquer forma, para sistemas com pelo menos 4GB de RAM, sugiro instalar a versão de 64 bits, porque (como no Windows) os sistemas de 32 bits não utilizam mais de 3GB de RAM.