Primeiro, vá para Control Options e confira o tipo de teclado físico na lista: qwerty, dvorak, 102 keys, 105 keys, etc. Escolha o modelo mais apropriado.
Abra um aplicativo "teclado na tela" (por exemplo, Florença) e veja como suas chaves reais são realmente mapeadas. Provavelmente você trocou o idioma do seu teclado por engano e acabou com um layout não padrão para outro idioma. Mude de volta para o padrão en (ou o que você estiver usando antes) clicando no ícone do idioma na barra de tarefas.