Isso provavelmente significa que você tem muitos arquivos grandes neste sistema de arquivos. Ou, na inicialização, a razão (provavelmente padrão) de inode por bytes não era o valor ideal.
Ter "muitos" inodes não é um problema em si, o problema é mais comum quando você tem muito pouco deles (você pode ter muito espaço livre em seu disco, mas se você não tiver nenhum inode livre você não poderá armazenar nada novo).
As coisas também dependem de qual arquivo você usa: ext3, ext4, xfs, reiserfs, btrfs, etc. Dê uma olhada nos mkefs específicos do seu sistema de arquivos para explicações sobre o uso do inode.