Em vez de usar o botão Desligar, tente
shutdown -h now
e veja se faz alguma coisa diferente. A opção -h pára o sistema depois de fechar todo o resto.
O Ubuntu não está desligando meu laptop Acer Aspire E1-510. As questões relacionadas não corrigiram esse problema. Espero que alguém possa ajudar a levantar este problema como um bug.
Em vez de usar o botão Desligar, tente
shutdown -h now
e veja se faz alguma coisa diferente. A opção -h pára o sistema depois de fechar todo o resto.