Se é exatamente esse programa específico para o qual você está voltando ao Windows, você já tentou instalar o 'wine' no Ubuntu e rodá-lo lá? O Wine tenta emular o Windows para que você possa rodar (alguns) programas do Windows, então vale a pena tentar se você quiser.
No que diz respeito à remoção do Ubuntu e à instalação do Windows, o procedimento geral é inserir o disco do Windows na inicialização e, em seguida, você deve obter instruções na tela sobre a instalação do Windows. Tanto quanto onde o Windows iria instalar (pelos sons que você está procurando instalar no Ubuntu) eu não sei as opções disponíveis durante a instalação do Windows, acredito que esta é uma pergunta melhor respondida em um fórum do Windows.