Você precisa usar um USB / DVD ao vivo para particionar o disco, pois o sistema de arquivos está bloqueado quando você o usa. Você pode fazer o download do disco ao vivo do site do Ubuntu. Depois de inicializar o disco ativo, abra o Gparted e formate o disco.
No entanto, o instalador do Windows também deve ser capaz de formatar e particionar o disco apropriadamente.