Eu acho que o problema é com o caminho, tente corrigir o caminho para
ln -s /usr/lib/jni/libswt-* ~/.swt/lib/linux/x86/
Você pode consultar este link
De acordo com a mensagem de erro Can't load library: /home/tom/.swt/lib/linux/x86_64/libswt-gtk-3740.so
parece que as bibliotecas devem estar em .swt/lib/linux/x86_64/
se não houver você pode tentar este comando:
locate libswt-gtk.so
isto deve encontrar as bibliotecas, copiar o diretório inteiro para
/home/tom/.swt/lib/linux/x86_64