Uma possível causa pode ser um bug existente no Ubuntu, que já existe há alguns anos: se você pressionar o atalho do teclado para alterar o layout do teclado, ele realmente mudará o layout, mas não a indicação no painel . Por exemplo, você estava usando russo em uma janela e agora está usando o inglês em outra janela. Então você muda o foco de volta para a primeira janela. Nesse caso, a entrada do teclado mudará automaticamente para o russo, mas o indicador do painel continuará mostrando EN. Além disso, se você usar o atalho do teclado para alterar a entrada, ele voltará para o inglês, mas o indicador mudará para o RU.