Os arquivos são apenas uma maneira de representar dados no lado do computador, o sistema de arquivos do Windows é suportado pelo Ubuntu e isso é óbvio, se você pode abrir uma foto jpg no Windows, então você pode abri-lo no Ubuntu. >
Mas, se você quer dizer que um vírus no Windows afeta o sistema no Ubuntu, e a resposta é não porque arquivos executáveis no Windows são considerados arquivos binários no Ubuntu, e na maioria das vezes eles não têm execução. privilégio para ser executado.
Você pode instalar o Ubuntu e escolher a partição do seu disco rígido, onde o Windows vive para remover o Windows.
Mas você pode usar o Windows / Ubuntu na mesma máquina até se sentir confortável o bastante com o Ubuntu.
Boa sorte