Você não menciona qual versão do Ubuntu você está usando, mas os pacotes estão disponíveis apenas para 14.04 até 15.10 neste momento, já que são quase 2 anos desde o PPA foram atualizados. Como 14.04 é o único deles atualmente suportado, estou fornecendo instruções para essa versão.
Para 14.04
Execute os seguintes comandos em um terminal
sudo add-apt-repository ppa:dpmva1/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install e2defrag
EDIT da página man:
Note that unlike the fsck program, defrag MUST NOT be run on a mounted file system device
(unless invoked with the -r (readonly) option, which is always safe). Also note that if you
defragment a partition containing a bootable kernel image and are using lilo ( grub doesn't
care unless you have it installed in the partition using blocklists instead of the MBR ), you
will have to reinstall the boot loader for that image (since the location on disk of the image
may have changed).
Remember, if defrag fails to complete for any reason (including power glitches, kernel bugs
etc.), you will be left with a terminally sick, and possibly completely unreadable, filesystem,
so backup any valuable data before you start.
Instalação testada em 14.04.5 Não tenho motivos para esperar que a liberação do ponto seja relevante.