Não é necessário limpar o computador primeiro. Instalando com a opção "Replace Microsoft Windows ..." as partições do Windows serão removidas e formatadas antes do Ubuntu ser instalado.
Então, no lado do software, não há nada a temer. Você ainda deve ter cuidado se a "corrupção" não resultar de hardware antigo e / ou instável. Faça um stress test para ter certeza de que seu hardware está confiável. Também execute o teste de memória do sistema live do Ubuntu.