Você removeu o suporte para uma linguagem na qual muitas funções e ferramentas do sistema são escritas. Elas dependem do python3, então o apt-get as removeu também. O que você tem é um sistema um pouco menos funcional, com funções importantes do sistema não funcionando.
Você pode, é claro, reinstalar o python3 (e todos os outros pacotes que você removeu), mas eu não ficaria surpreso se isso for muito mais complicado do que simplesmente reinstalar o sistema, especialmente se for uma nova instalação.
Linux (incluindo o Ubuntu) permite que você faça coisas estúpidas por design. Isso permite que você crie sistemas de iluminação cuidadosamente criados para tarefas específicas - sacrificando a funcionalidade.
Em suma, o apt (-get) imprimiu todas as mudanças - incluindo a remoção do seu ambiente de desktop. Se você quiser mexer com pacotes importantes, é uma boa ideia ler a lista de pacotes - se mais de 15 a 20 pacotes estiverem listados, é quase sempre um sinal de que você provavelmente não deseja executar essa ação. .
Você pode tentar executar sudo apt-get install xubuntu-desktop . O xubuntu-desktop é um metapacote, portanto, ele instalará todos os pacotes padrão necessários para o sistema de desktop xubuntu.
Se você executar ações aleatórias como superusuário, sem ler a saída, eu diria que nenhum SO é seguro. Tente ir para uma máquina Windows e exclua por exemplo arquivos aleatórios em %windir%\System32 . E para o futuro - leia a saída do apt. E pratique usando --dry-run