Primeiramente bem-vindo ao Ubuntu. Nada que você descreveu soa anormal e, embora seja possível que você tenha sido "hackeado", é extremamente improvável.
Como acontece com qualquer sistema operacional, leva algum tempo para entender coisas novas e novas formas de administração do sistema.
Sugiro que comece com os 2 links a seguir:
E, em seguida, trabalhe na documentação oficial
Depois de ter começado, volte se tiver uma pergunta mais específica.