Existem meta-pacotes disponíveis para ambos os desktops (MATE e Xfce4) que instalam todos os pacotes necessários para fornecer a área de trabalho desejada. Você também deve ser capaz de selecionar qual área de trabalho iniciar na tela de login.
O MATE pode ser instalado com o comando da seguinte forma:
apt-get install mate-desktop-environment
O Xfce4 pode ser instalado com o comando da seguinte forma.
apt-get install xfce4
Para ambos os desktops, você pode querer instalar outros pacotes. Para fazer isso, use apt-cache search mate
ou apt-cache search xfce
para listar os pacotes disponíveis.