Como esses diretórios são o resultado de tentativas de backup com falha, presumo que você não tenha dados neles que deseja preservar ou que já salvou os dados em outro lugar.
NOTA não deixe de digitar este comando com precisão - você pode quebrar seu sistema com erros de digitação neste comando.
sudo rm -rf /media/Home
Isso excluirá o diretório e todos os arquivos e diretórios abaixo dele.