Resposta curta: não use o anaconda se você não souber o que está fazendo.
Resposta longa: você está usando uma instalação do python (anaconda) que existe junto com a instalação do sistema python. Se você instalar um pacote python do sistema, ou, no caso do kivy, um pacote que é feito para o python do sistema, provavelmente não é visto pelo anaconda.
Para usá-lo, você deve instalar o pacote da maneira que o anaconda deseja (além do escopo deste site), ou você precisa iniciar o interpretador python do sistema, que é /usr/bin/python
.
Na página inicial do Kivy, você encontrará instruções sobre como instalar usando ambientes virtuais ( link ), eu recomendo este método se você não estiver usando a instalação padrão do sistema python.