O diretório / var / run deve ser um link para / run (similarmente para / var / lock é um link para / run / lock). Verifique isso com:
$ ls -ald /run /var/run /var/lock /run/lock
Você deve ver algo vincular isso:
drwxr-xr-x 38 root root 1220 Jun 24 07:35 /run
drwxrwxrwt 5 root root 140 Jun 23 16:51 /run/lock
lrwxrwxrwx 1 root root 9 Oct 21 2011 /var/lock -> /run/lock
lrwxrwxrwx 1 root root 4 Mar 22 2014 /var/run -> /run
Se você não fizer isso, isso apontaria para o problema, mas não por que ele está nesse estado. Consulte o link para uma possível correção.