Minha solução para isso seria particionar o HDD com 4 partições,
1 partição inicializável para a sua instalação parcial do Ubuntu (digite 83 formatado como ext3, ext4 ou qualquer sabor que você goste ...) monte em /
2 partições (tipo 83, formatadas como # 1) são montadas em / usr
3 partição (digite 6,7, b, c (qualquer sistema de arquivos do tipo DOS que você queira, formatado como MSDOS) monte em / home #
4 partição (tipo 82 formatado como swap linux) montar como swap.
Com esta configuração, o Linux montará o / home (/ dev / hdd3) como um sistema de arquivos do MSDOS e não se importará. O Windoze agora reconhecerá o diretório / home como um sistema de arquivos do MSDOS e poderá montar / ler / gravar nele.
Espero que isso funcione para você!