Os anúncios da Amazon são especificamente parte do shell do Unity. O Xubuntu usa o desktop Xfce, não o Unity; O Xfce fornece seu próprio painel e executa o diálogo. Então, sim, o recurso não será ativado ao executar uma sessão do Xfce.
Como alternativa, é possível usar o Unity com os resultados de pesquisa da Amazon desativados: Como posso remover os resultados da pesquisa da Amazon do painel ou desativar o recurso? .