Não, em geral, não é necessário fechar os aplicativos antes do upgrade da distribuição. Mas é recomendado porque durante o processo de upgrade toneladas de bibliotecas serão atualizadas (a maioria acontece como, primeiro remova o antigo e depois instale o lib uptado), e isso pode causar problemas durante o tempo de execução do aplicativo se estiver usando a (s) biblioteca (s) para ser atualizado, o que resulta em exceção e perda de dados.