Eu tive o mesmo problema e o que resolveu o problema para mim foi iniciar o aplicativo com alguns segundos de atraso.
crie um script bash e adicione o seguinte
#!/bin/sh
sleep 5
/usr/bin/conky
salve o arquivo e execute chmod + x conky.sh
Em seguida, abra o aplicativo de inicialização do gnome ou edite: ~ / .config / autostart / conky.desktop e atualize o Exec / Command para: /home/youruser/conky.sh
(Apenas substitua o conky pelo aplicativo que você está usando) Agora tente logout e voltar novamente e espero que deva funcionar se ele funcionar, você pode tentar aumentar o tempo de espera / atraso para 10 segundos.