Eu estava recebendo o mesmo erro ao lançar o grub-customizer no ubuntu 18.04, o que eu fiz foi encontrar o caminho da biblioteca ausente:
$ sudo find / -name "libatkmm-1.6.so.1"
/snap/gnome-system-monitor/36/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libatkmm-1.6.so.1
depois disso, incluí o diretório lib no arquivo que configura a variável de ambiente libs:
$ sudo su
# echo "/snap/gnome-system-monitor/36/usr/lib/x86_64-linux-gnu" >> x86_64-linux-gnu.conf
# ldconfig
e funcionou.
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OU você pode criar links simbólicos em um caminho da biblioteca já padrão:
sudo ln -s /snap/gnome-system-monitor/36/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libatkmm-1.6.so.1.1.0 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libatkmm-1.6.so.1
sudo ln -s /snap/gnome-system-monitor/36/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpangomm-1.4.so.1.0.30 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpangomm-1.4.so.1
sudo ln -s /snap/gnome-system-monitor/36/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libglibmm-2.4.so.1.3.0 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libglibmm-2.4.so.1
sudo ln -s /snap/gnome-system-monitor/36/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcairomm-1.0.so.1.4.0 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcairomm-1.0.so.1
sudo ln -s /snap/gnome-system-monitor/36/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libsigc-2.0.so.0.0.0 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libsigc-2.0.so.0
sudo ln -s /snap/gnome-system-monitor/36/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgiomm-2.4.so.1.3.0 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgiomm-2.4.so.1