Eu tive um problema semelhante no laptop da minha mãe. Eu estou supondo que você tem uma partição / home separada e quer usar isso com a instalação limpa, certo? Em caso afirmativo, é provável que o diretório do usuário não tenha permissões de arquivo reconhecíveis para o novo sistema. Se sim, faça isso:
Limpe a instalação, mas em vez de definir seu novo usuário como nome de usuário original, escolha um novo (temporário). Isso permitirá que você inicialize em sua área de trabalho. Depois de fazer isso, use o aplicativo "Usuários" para criar um novo usuário com seu nome de usuário original e dar a ele o login automático. Então faça:
cd /home
sudo chown -R youruser.youruser youruser
(swap youruser para o nome que você quer) Isso irá definir suas permissões corretamente. Agora você pode reinicializar seu usuário com todas as suas configurações, dados, etc.